La saison sèche, de décembre à avril, représente la période optimale pour visiter Bacalar. Les températures oscillent entre 24°C et 28°C, avec un taux d'humidité modéré et des précipitations quasi inexistantes. Cette période coïncide avec la haute saison touristique, nécessitant une réservation anticipée des hébergements.
Les mois de mai et novembre constituent un excellent compromis, offrant des conditions météorologiques favorables avec moins d'affluence. Les températures restent agréables, autour de 26°C, tandis que les tarifs hôteliers sont généralement plus attractifs.
La saison des pluies, de juin à octobre, présente certains avantages malgré les précipitations. Les averses, généralement courtes et en fin de journée, rafraîchissent l'atmosphère. La végétation luxuriante atteint son apogée, créant des paysages d'une beauté exceptionnelle. Cette période convient aux voyageurs flexibles recherchant des tarifs avantageux.
La température de l'eau reste constante toute l'année, autour de 26°C, permettant la baignade en toute saison. Les vents sont généralement faibles, maintenant la surface de la lagune calme et propice aux activités nautiques.