La temporada seca, de diciembre a abril, es el periodo óptimo para visitar Bacalar. Las temperaturas oscilan entre 24°C y 28°C, con una humedad moderada y precipitaciones prácticamente inexistentes. Esta época coincide con la alta temporada turística, por lo que se recomienda reservar alojamientos con antelación.
Los meses de mayo y noviembre suponen un excelente compromiso, con condiciones meteorológicas favorables y menos afluencia. Las temperaturas siguen siendo agradables, alrededor de 26°C, mientras que las tarifas hoteleras suelen ser más atractivas.
La temporada de lluvias, de junio a octubre, tiene ciertas ventajas pese a las precipitaciones. Las lluvias, generalmente breves y al final del día, refrescan la atmósfera. La vegetación exuberante alcanza su máximo esplendor, creando paisajes de belleza excepcional. Esta época es ideal para viajeros flexibles que buscan tarifas ventajosas.
La temperatura del agua se mantiene constante todo el año, alrededor de 26°C, permitiendo el baño en cualquier estación. Los vientos son generalmente leves, manteniendo la superficie de la laguna calmada y propicia para actividades náuticas.